日本拥有众多知名大学，根据不同的排名标准和分类，以下是一些日本顶尖的大学：

国际超一流大学（S级）

东京大学：成立于1877年，是日本最顶尖的大学之一，以理科和工科在世界上领先。

京都大学：位于京都市，是日本顶尖的研究型国立大学，以科学研究和学术成就著称。

国际一流大学（A级）

大阪大学：位于大阪府，是日本关西地区的重要综合性大学。

名古屋大学：成立于1871年，是日本顶尖的综合研究型国立大学。

东京工业大学：位于东京都，专注于工程技术与自然科学的研究。

一桥大学、 东北大学、 庆应义塾大学、 九州大学、 北海道大学：都是各自领域内领先的日本国立大学。

国内一流大学（B级）

筑波大学、 早稻田大学、 神户大学、 上智大学、 御茶水女子大学、 广岛大学、 横滨国立大学、 东京外国语大学：这些大学在日本国内享有较高的声誉，并在各自的学科领域有着显著的影响力。

其他著名大学

神户大学：位于神户市，是日本关西地区著名的一流国立大学，尤其在经济学和经营学领域评价极高。

立命馆亚洲太平洋大学、 会津大学：这些大学也在各自的领域有着较高的国际声誉和学术成就。

以上排名和分类可能随时间和不同评价机构的标准有所变化，但上述提及的大学在日本乃至国际上都有很高的知名度和影响力。