南京的重点大学包括以下几所：

南京大学：

简称“南大”，是教育部直属的全国重点大学，属于“双一流”A类、“211工程”和“985工程”重点建设高校。

东南大学：

简称“东大”，位于江苏省南京市，是教育部直属的全国重点大学，属于“双一流”A类、“211工程”和“985工程”重点建设高校。

南京农业大学：

简称“南农”，坐落于南京市，是一所以农业科学与生命科学为优势和特色的教育部直属全国重点大学，属于“双一流”和“211工程”重点建设高校。

南京航空航天大学：

简称“南航”，是工业和信息化部直属的全国重点大学，以理工类为主，属于“211工程”和“985工程”重点建设高校。

河海大学：

简称“河海”，是一所具有百年历史的教育部直属全国重点大学，以水利为特色，工科为主，多学科协调发展。

南京理工大学：

简称“南理工”，是一所隶属于工业和信息化部的全国重点大学，以工科为主。

中国药科大学：

简称“药大”，是教育部直属的全国重点大学，以药学为特色。

南京师范大学：

是教育部直属的全国重点大学，属于“211工程”重点建设高校。

这些大学在各自的领域有着较高的声誉和影响力，是江苏省乃至全国知名的高等教育机构。