在南通市，根据最近的信息，以下是顶尖大学的排名情况：

南通大学

简称“通大”，是江苏省人民政府和交通运输部共建的综合性大学。

包含多个强势学科，如机械工程、材料科学与工程、计算机科学与工程、物理学等。

学校始建于1912年，由私立南通医学专门学校和南通纺织专门学校合并组建。

拥有硕士学位授予权。

南通理工学院

简称“通理工”，是一所全日制普通本科高校。

前身为紫琅职业技术学院，成立于2000年，2014年升格为本科院校。

定位在高等职业技术教育，旨在培养实用型复合型人才。

南通大学杏林学院

是经教育部批准设置的独立学院，依托南通大学的优质资源。

设有48个专业，涵盖多个学科门类。

以上排名根据最近的信息整理得出，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。