南京拥有吉他专业的大学包括：

南京艺术学院：

音乐学院内有吉他专业，提供系统的吉他课程，并经常举办吉他相关活动。

南京师范大学：

艺术学院设有民乐制作与演出专业，其中包括吉他教学。

南京中医药大学艺术学院：

民乐专业水平高，学生曾在国内外大赛中获奖。

东南大学：

也招收艺术特长生，可能有吉他相关专业或课程。

南京大学：

作为综合性大学，可能设有艺术类专业或课程，包括吉他。

此外，还有一些培训机构如南京飞音吉他专修学校提供吉他教学服务。

如果您需要更详细的信息，例如具体的课程设置、师资力量等，请告知