平遥县内的本科大学包括：

山西农业大学（太古校区），位于山西省晋中市太谷区明贤南路1号。

太原理工大学（明向校区），位于山西省晋中市榆次区大学街209号。

山西医科大学汾阳学院，位于吕梁市汾阳市学院路16号。

此外，根据2024年5月1日的信息，平遥县还与浙江大学、重庆大学等8所高校签订了战略合作框架协议，这意味着这些大学在某种程度上与平遥县有合作关系，尽管它们可能不在平遥县内设有校区。