阜阳师范大学设有以下学院：

1. 文学院

2. 外国语学院

3. 数学与统计学院

4. 物理与电子工程学院

5. 计算机与信息工程学院

6. 商学院

7. 经济学院

8. 法学院

9. 历史文化与旅游学院

10. 生物与食品工程学院

11. 化学与材料工程学院

12. 音乐舞蹈学院

13. 美术学 院

14. 体育学院

15. 教育学 院

16. 继续教育学院

此外，还有信息工程学院作为二级学院