昆山开放大学实行二级管理，下设的系包括：

交通工程系

经贸管理系

信息与自动化系

公共教学部

昆山开放大学提供的专业有：

汽车运用与维修

城市轨道交通运营管理

新能源汽车运用与维修

工程造价

园林技术

计算机网络技术

计算机平面设计

电子技术应用

电气运行与控制

数字媒体应用技术

物流服务与管理

市场营销

电子商务

会计

报关与国际货运

商务英语等24个专业