安徽科技学院的机构设置包括：

基础实验教学中心：

负责提供实验教学服务。

专业实验室：

支持各个学科的教学和研究工作。

学科平台：

为学科发展提供平台支持。

国家级科技创新平台：

参与国家级的科研创新活动。

国家级大学生校外实践教育基地：

为学生提供校外实践机会。

安徽科技学院还设有凤阳校区和蚌埠龙湖校区，以及在建的滁州校区。学校占地面积广阔，拥有丰富的教学和科研资源。