武汉地区拥有航海系的大学包括：

武汉理工大学- 拥有航海技术专业，是全国知名的航海技术院校之一。

武汉航海职业技术学院- 提供航海技术系等多个相关院系。

湖北交通职业技术学院- 也提供与航海相关的专业。

以上信息基于最近的数据更新，具体排名和设置可能会有变动，建议直接咨询相关院校或查看最新的招生简章获取最准确的信息