黄埔区位于广州，根据提供的信息，黄埔区内的顶级学校包括：

国防科技大学：

位于湖南长沙，是军队院校中唯一的985高校，被称为“军中清华”或“军中黄埔”。

北京邮电大学：

位于北京，是211工程高校，被誉为“中国信息科技人才的摇篮”或“信息黄埔”。

西南政法大学：

位于重庆，是新中国最早建立的高等政法学府，被誉为“法学黄埔军校”。

华北电力大学：

位于北京，是国家“211工程”和“985工程优势学科创新平台”重点建设大学，被称为“电力黄埔”。

长安大学：

位于西安，是由原西安公路交通大学、西安工程学院、西北建筑工程学院合并组建而成，是教育部与交通运输部、陕西省人民政府、国土资源部、住房和城乡建设部共建的全国重点211大学，被称为“公路界黄埔军校”。

这些学校各自在各自的领域有着显著的影响力和较高的声誉，因此可以被视为黄埔区的顶级学校