高淳区目前拥有的大专院校包括：

南京理工大学紫金学院

南京机电职业技术学院

南财红山学院

江苏卫生健康职业学院

苏州科技大学天平学院

此外，还有规划中的三所大学：

南京工业大学高淳校区

南京机电职业技术学院高淳校区

南京医科大学高淳校区

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