吉首市的高等院校主要包括：

吉首大学

吉首大学是一所省属综合性大学，由吉首校区和张家界校区组成。

成立于1958年9月，是湖南省内一流学科建设高校，也是武陵山片区唯一的综合性大学。

拥有博士后科研流动站2个，一级学科博士点1个，一级学科硕士点16个，专业硕士点17个。

设有教学学院22个，本科专业73个，覆盖了12大学科门类。

校庆日为每年的9月12日。

湘西民族职业技术学院

湘西民族职业技术学院是湘西自治州唯一一所普通高等职业技术院校。

成立于2004年5月，是教育部备案的院校。

以上信息根据最新的参考资料整理得出，具体信息可能会有所变动，建议访问学校官网或联系学校获取最新信息