林芝农牧学院（或称为西藏农牧学院）的专业设置包括：

1. 农学

2. 林学

3. 水利水电工程

4. 电气工程及其自动化

5. 动物科学

6. 食品科学与工程

7. 园林

8. 草业科学

9. 动物医学

10. 园艺

11. 植物保护

12. 森林保护

13. 农林经济管理

14. 农村区域发展

15. 自然地理与资源环境

16. 环境工程

17. 环境科学

请注意，专业设置可能会根据时间和学校政策有所变动，建议以学校最新公布的信息为准。