南京的名牌大学包括：

南京大学：

985和211工程重点大学，华东五校之一，全国排名前列。

东南大学：

985和211工程重点大学，全国排名中上，工科实力强。

南京航空航天大学：

211工程大学，工信部直属，航空专业特色。

南京理工大学：

211工程大学，国防七校之一，兵工类专业突出。

南京师范大学：

211工程大学，国家双一流建设计划，师范类专业知名。

河海大学：

211工程大学，以水利为特色，学科全面。

南京农业大学：

211工程大学，教育部直属，农林类专业顶尖。

南京工业大学：

工业院校，以工科见长。

中国药科大学：

医药类重点大学，专业性强。

南京邮电大学：

信息通讯领域知名学府。

以上排名不分先后，每所大学都有其独特的专业和学科优势。您可以根据自己的兴趣和目标选择适合的大学进行申请和学习