大学新生在报到时需要上交的主要档案包括：

1. 高中阶段的学籍档案，这通常包括：

高中毕业生登记表

高中生学籍卡

高中三年学生成绩登记表

入团志愿书（如果有）

表彰材料（如三好生、奖学金等）

2. 报考高校时形成的材料，可能包括：

普通高校招生考生报名登记表

考生当前信息（含高考成绩、志愿等）

普通高校招生考生体格检查表

3. 高校阶段形成的材料，通常包括：

学生登记表

高校毕业生登记表

学习成绩登记表（包括学士学位获得情况）

师范生的教育实习成绩表，非师范生的专业实习成绩表

毕业生就业通知书

体检表、军训情况总结表

4. 其他可能需要的材料，如：

各种奖励材料

专业证书复印件（如英语四六级、计算机等级证书等）

各种聘书（如学生会、团委会等部门任职的聘书）

党员材料（如党校培训结业证书、入党志愿书等）

5. 身份证明文件，如：

身份证

户口本复印件（如果需要迁移户口）

团员证以及转团组织关系的资料（入团志愿书、介绍信）

党员档案和转党组织关系的相关资料（预备党员和党员需要准备）

6. 其他可能需要的文件，如：

一寸、两寸照片至少各一版

高考准考证（如果适用）

贫困证明（申请助学金等可能用到）

生源地贷款回执单（如果适用）

请注意，具体需要哪些材料可能因学校而异，建议提前咨询所在大学以获取最准确的信息