南京理工大学在多个学科领域表现出色，以下是一些王牌专业和热门专业：

兵器科学与技术：

连续在第四轮和第五轮学科评估中获得A+评级，在全国排名第一。

化学工程与技术：

在第五轮学科评估中获得A评级。

机械工程：

在多个评估中获得A-评级，并在国内享有良好声誉。

武器系统与工程：

国家级一流本科专业建设点，江苏省品牌专业。

电子信息工程：

在第五轮学科评估中获得A评级，并在国内具有较高的声誉。

软件工程：

在第五轮学科评估中获得A评级。

环境工程：

在多个评估中获得B评级，并在国内具有一定的竞争力。

材料科学与工程：

在材料制备、性能和应用等多个方向具有高水平研究。

计算机科学与技术：

在国内具有较高的声誉，培养了大量优秀的计算机人才。

自动化：

在国内享有较高声誉，培养了大量在自动化领域具有深厚理论基础和实践能力的人才。

请注意，以上信息以最新的评估结果为准，具体排名和专业可能会随着时间和学校政策有所变动。