南岗区拥有多所高等教育机构，其中包括：

1. 哈尔滨工业大学（哈工大）

2. 哈尔滨工程大学（哈工程）

3. 黑龙江大学（黑大）

4. 哈尔滨医科大学（哈医大）

5. 哈尔滨理工大学（哈理工）

6. 黑龙江工程学院

7. 哈尔滨学院

8. 黑龙江职业技术学院

9. 黑龙江旅游职业技术学院

10. 黑龙江护理高等专科学校

11. 东方学院

这些大学中，哈尔滨工业大学是985和211工程的重点大学，以工科为主，同时在理、文、管、法等多个领域均有显著成就。其他大学如黑龙江大学、哈尔滨医科大学等也是各自领域内知名的教育机构。学府路是南岗区著名的校园一条街，分布着众多高等教育机构。

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