厦门医学院目前设有以下本科专业：

1. 药学系：生物制药、药学、中药学、海洋药学

2. 临床医学系：精神医学、麻醉学、康复治疗学、临床医学

3. 公共卫生与医学技术系：卫生检验与检疫技术、食品质量与安全、化妆品技术与工程、预防医学、医学检验技术、化妆品经营与管理

4. 护理系：护理学、助产学

5. 口腔医学系：口腔医学

此外，厦门医学院还设有针灸推拿、康复治疗技术、口腔医学技术、护理、助产、医学美容技术、健康管理、卫生信息管理、眼视光技术等9个专科专业