根据提供的信息，2025年应用电子工程学院的排名如下：

1. 电子科技大学

2. 哈尔滨工业大学

3. 西安电子科技大学

这些排名信息基于软科发布的最新大学排名榜，其中电子科技大学在电子信息工程专业中排名第一，显示其实力最强。

请注意，排名信息仅供参考，选择院校时还需考虑其他因素，如专业特色、研究方向、师资力量、就业前景等。