在2019年北京市大学排名中，北京大学位列第一，清华大学位居第二。具体排名如下：

1. 北京大学 - 综合得分100，全国排名1位

2. 清华大学 - 综合得分97，全国排名2位

3. 中国人民大学 - 综合得分未提及，全国排名3位

4. 北京航空航天大学 - 综合得分未提及，全国排名9位

5. 北京师范大学 - 综合得分未提及，全国排名19位

以上排名是根据各大学在学术研究、人才培养、社会声誉等多个方面进行的评估。