南京工程学院在不同省份的招生批次有所不同，因此其是否为一本或二本院校取决于具体省份的招生政策。根据提供的信息，南京工程学院在部分省份如河南、安徽是作为第一批次录取的，而在其他省份如四川、贵州、陕西、宁夏、广西、江西、黑龙江、山西、甘肃、云南则是作为第二批次招生。因此，不能一概而论地说南京工程学院是几本院校，需要根据具体省份的招生情况来确定。

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