90年代上海的知名大学包括：

上海交通大学：

简称“上海交大”，创建于1896年，是中国历史悠久的著名高等学府之一，属于“985工程”、“211工程”和“世界一流大学建设高校”。

复旦大学：

成立于1905年，是中国人自主创办的第一所高等院校，2000年与上海医科大学合并。

同济大学：

创建于1907年，是一所具有鲜明特色和较大国际影响力的综合性、研究型、国际化大学。

华东师范大学：

是解放前就已存在的大学之一。

上海师范大学：

同样是在解放前就有的学校之一。

上海科技大学：

也是90年代上海较为知名的高等教育机构。

这些大学在当时及之后都享有较高的声誉，并为上海乃至全国的学术研究和人才培养做出了重大贡献