南京拥有莲花的大学包括：

南京农业大学：

该校有荷花和莲花研究团队，并在其官方微博中提到了荷花。

南京工业大学：

校内盛开有荷花，尤其在镜湖、北苑、东苑等地。

江苏大学：

江苏大学的官方微博也转发了有关莲花绽放的消息。

南京理工大学：

虽然主要提及的是荷花，但作为以理工科为主的高校，也可能有莲花的种植。

以上信息基于最近发布的微博动态，具体情况可能会有所变化，建议直接访问相关大学的官方网站或实地考察以获得最新信息