南通共有九所大学，以下是部分大学的列表：

南通大学- 综合性大学，由江苏省人民政府和交通运输部共建。

南通理工学院- 属于本科层次的教育机构。

南通大学杏林学院- 南通大学的独立学院。

江苏航运职业技术学院- 专科层次的教育机构，重点推荐。

江苏工程职业技术学院- 专科层次的教育机构。

南通职业大学- 专科层次的教育机构。

江苏商贸职业学院- 专科层次的教育机构。

南通师范高等专科学校- 专科层次的教育机构。

南通科技职业学院- 专科层次的教育机构。

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