南京最牛大学的排名如下：

南京大学

全国排名：第5名

特点：985工程、211工程、双一流A类建设高校，拥有多个优势学科，如天文学、地质学、图书情报与档案管理等。

东南大学

全国排名：第17名

特点：985工程、211工程、双一流A类建设高校，以工科为主要特色，涵盖多个学科领域。

河海大学

全国排名：第37名

特点：211工程，以水利方面较为强势。

南京农业大学

全国排名：第38名

特点：211工程、985优势学科创新平台、双一流建设高校，以农业和生命科学为优势和特色。

南京理工大学

全国排名：第43名

特点：211工程，军工院校。

南京航空航天大学

全国排名：第50名

特点：211工程，以航空航天领域具有一定的话语权。

南京师范大学

全国排名：第62名

特点：211工程。

南京工业大学

全国排名：未提及

特点：2011牵头高校，以化工、土建为主。

南京邮电大学

全国排名：未提及

特点：虽非211，但通信专业较为全面，招生分数普遍较高。

中国药科大学

全国排名：未提及

特点：211工程。

以上排名根据最近的信息整理得出，具体排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化。