连州市拥有以下本科大学：

江苏海洋大学：

这是一所公办大学，以海洋、水产为特色，同时注重工学、理学、管理学、文学、法学等多学科协调发展。

南京医科大学康达学院：

这是一所民办大学，由南京医科大学创办，并在2013年迁至连云港办学。

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