南通最好的大学是南通大学（Nantong University），简称“通大”，位于江苏省南通市。这是一所由江苏省人民政府和交通运输部共建的综合性大学，属于江苏省十五所重点建设大学之一，并且是国家“卓越医生教育培养计划”和“卓越教师培养计划”的试点高校。南通大学在本科教学工作水平评估中被评为优秀，并且是全国首批硕士和学士学位授予单位，博士学位授予单位，以及全国普通高等学校毕业生就业工作先进集体。