新疆农业大学的专业设置十分全面，涵盖了农、理、工、经、管、文、法等多个学科门类。以下是一些主要的专业：

农学类专业

农学

园艺

植物保护

农业资源与环境

种子科学与工程

设施农业科学与工程

林学

森林保护

园林

水利水电工程

农业水利工程

土地资源管理

农业机械化及其自动化

物联网工程

理学类专业

环境科学

统计学

工学类专业

机械设计制造及其自动化

土木工程

电气工程及其自动化

计算机科学与技术

经济学

国际经济与贸易

管理学类专业