蔡元培先生的名字被用于命名两所大学的元培学院，分别是：

北京大学元培学院：

这是一所一本大学，即一类本科教育。北京大学在创建世界一流大学的过程中，以蔡元培先生的名字命名了元培学院，并实行了“加强基础，分流培养，因材施教，淡化专业”的本科教育改革计划。

绍兴文理学院元培学院：

这是一所二本大学，即二类本科教育。绍兴文理学院元培学院坐落于浙江省绍兴市，是一所全日制本科独立学院，由中国近代教育家、思想家蔡元培先生的名字命名，由绍兴文理学院与中国绍兴黄酒集团有限公司合作举办。

请注意，根据教育部的规定，目前没有明确的一批次、二批次的概念，绍兴文理学院元培学院是一所综合类独立学院。