南通最好的大学排名如下：

南通大学

类型：综合性大学

星级排名：2星级

备注：江苏省人民政府和交通运输部共建，江苏高水平大学建设高峰计划B类高校，拥有丰富的本科专业和学科门类。

南通理工学院

类型：全日制普通本科高校

星级排名：无具体星级

备注：前身为紫琅职业技术学院，2014年升格为本科院校。

南通大学杏林学院

类型：独立学院

星级排名：无具体星级

备注：以南通大学启东校区作为办学校园，设有多个专业，涵盖多个学科门类。

以上排名根据最近的信息整理得出，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。