在2016年中国农林类大学的排名中，中国农业大学排名第一，南京农业大学排名第二，华中农业大学排名第三。以下是具体的排名情况：

1. 中国农业大学

地区：北京

排名：第1位

办学层次：中国一流大学

2. 南京农业大学

地区：江苏

排名：第2位

办学层次：中国高水平大学

3. 华中农业大学

地区：湖北

排名：第3位

办学层次：中国高水平大学

4. 西北农林科技大学

地区：陕西

排名：第4位

办学层次：中国高水平大学

5. 北京林业大学

地区：北京

排名：第5位

办学层次：中国高水平大学

6. 华南农业大学

地区：广东

排名：第6位

以上排名信息根据中国校友会发布的2016年中国大学排名榜单整理得出