根据软科2024年专业排行榜，2024年粒子物理与原子核物理专业全国排名前三的大学如下：

清华大学

北京大学

中国科学技术大学

这些排名基于软科发布的最新排名榜单，具体排名情况如下：

清华大学排名第一

北京大学排名第二

浙江大学排名第三

上海交通大学、复旦大学、南京大学、中国科学技术大学、华中科技大学、武汉大学、西安交通大学位列前十