当前交通运输部直属的高校有以下几所：

大连海事大学

主管部门：交通运输部

所在地：辽宁省大连市

层次：本科

备注：国家重点大学，"211工程"和"双一流"建设高校

中国民航大学

主管部门：交通运输部（中国民用航空局）

所在地：天津市

层次：本科

备注：高水平特色大学建设高校

中国民用航空飞行学院

主管部门：交通运输部（中国民用航空局）

所在地：四川省德阳市

层次：本科

备注：公办

上海民航职业技术学院

主管部门：交通运输部（中国民用航空局）

所在地：上海市

层次：专科

备注：公办

广州民航职业技术学院

主管部门：交通运输部（中国民用航空局）

所在地：广东省广州市

层次：专科

备注：公办

这些高校在交通运输领域内具有较高的声誉和影响力，培养了大量优秀的交通运输专业人才