当前中国被认定为211工程的医科大学共有五所，它们是：

1. 北京中医药大学（位于北京）

2. 天津医科大学（位于天津）

3. 中国药科大学（位于南京）

4. 第二军医大学（军事类，位于上海）

5. 第四军医大学（军事类，位于西安）

这些院校在医学教育、科研和临床服务等方面具有显著优势，并且拥有多个国家级重点学科和实验室。