考研自命题的改卷流程通常如下：

试卷收集：

考试结束后，考生的自命题专业课试卷会被密封并运送到报考院校。

试卷批改：

自命题专业课试卷由报考院校的相关院系老师进行批改。

阅卷方式：

目前，考研初试的英语、政治和数学等统考科目是采用计算机阅卷，而专业课（包括自命题科目）则一般采用手工阅卷。

评分与反馈：

批改完成后，老师会根据考生的答题情况给出分数，并将成绩汇总。

考生需要注意的是，自命题专业课的题目和评分标准可能因院校而异，因此考生应提前了解并适应目标院校的出题思路和评分标准。