合肥学院的王牌专业包括：

1. 自动化

2. 通信工程

3. 机械电子工程

4. 化学工程与工艺

这些专业根据合肥学院在四川省理科生的最低录取分数线排名得出，也可以看作是合肥学院在四川理科最热门、最难考上的专业。

此外，合肥学院还有其他一些优势专业，如：

电子信息工程

计算机科学与技术

机械设计制造及其自动化

物流管理

经济工程

新闻学

旅游管理

请注意，专业排名可能会随着时间和各种因素（如教学质量、就业率等）的变化而有所调整。建议查看合肥学院官方网站或相关教育评估报告获取最新信息