河海大学拥有多个王牌专业和特色专业，以下是一些备受认可的专业：

水利工程：

包括水利水电工程、水文与水资源工程、港口航道与海岸工程、土木工程、环境工程等。

计算机科学与技术

电气工程及其自动化

新能源科学与工程

物联网工程

农业水利工程

热能与动力工程

通信工程

工程力学

海洋科学

这些专业在各自的领域内具有很高的声誉，并且很多专业被评为国家特色专业、双一流学科或国家重点学科。特别是港口航道与海岸工程专业，在全国港航专业中处于领先地位，并且毕业生就业率高，就业质量好。