滨州学院设有多个院系，主要包括但不限于以下：

飞行学院

航空工程学院

机场学院

乘务学院

机电工程学院

电气工程学院

信息工程学院（计算机基础教学部）

建筑工程学院

化工与安全学院

生物与环境工程学院

经济管理学院

外国语学院（大学英语教学部）

人文学院

马克思主义学院

教师教育学院

外语系（大学英语教学部）

经济管理系

数学系

电气工程系

化学工程系

建筑工程系

信息工程系（计算机基础教学部）

机电工程系

生命科学系

资源环境系

体育系（公共体育教学部）

音乐系

美术系

继续教育学院（远程教育中心）

滨州学院是一所全日制普通本科院校，提供多种本科专业和专科专业，面向全国多个省份招生