根据最新的信息，南京大学软件工程学科在全国的排名情况如下：

在2023年9月12日发布的校友会2023中国大学一流学科排名中，南京大学软件工程学科位居全国第5名。

在软科2022中国大学专业排名中，南京大学软件工程专业位居全国第二名。

在2024年5月1日的信息中提到，南京大学软件工程学科在全国一直备受认可，并且是考生学习软件工程学科非常好的选择，排名第5的是南京大学。

请注意，排名情况可能会随着时间和评价机构的不同而有所变化，建议以最新的官方信息或权威排名机构的数据为准。