根据提供的信息，2024年上海市青浦区毓秀学校在青浦区内的排名如下：

1. 上海市青浦高级中学

2. 上海市青浦区第一中学（青浦一中）

3. 上海市青浦区朱家角中学

4. 上海市青浦区北崧中学

5. 上海市青浦区毓秀学校（中学部）

6. 上海市瑞大学校（中学部）

7. 上海市青浦区毓华学校

8. 上海法国学校

9. 复旦附中青浦分校

10. 上海市青浦区实验中学

毓秀学校（中学部）在2024年的排名是第5位