南京的公办大学排名如下：

南京大学

全国排名：第6位

特点：自然科学、社会科学和人文学科方面有卓越的研究成果，尤其在物理学、化学和生命科学等领域享誉全球。

东南大学

全国排名：第21位

特点：以建筑学、土木工程、电子信息等领域有强大的学术影响力，以工科闻名，是中国工程教育的领军者之一。

南京理工大学

全国排名：第37位

特点：以兵器科学与技术、材料科学、机械工程等学科见长，是中国国防科技和工程技术研究的重要基地。

南京农业大学

全国排名：第44位

特点：农业学科在国内领先，第四轮学科评估中拥有四个A+学科。

南京航空航天大学

全国排名：第51位

特点：航空、航天学科优势明显。

中国药科大学

全国排名：第58位

特点：药学、中药学等学科实力雄厚。

以上排名信息根据最近的数据更新，排名不分先后。