当前男科专业院校排名如下：

北京大学第一医院男科中心

综合性医院，集医疗、教学、科研为一体。

男科科室成立于1994年，是国内男科领域的先行者之一。

拥有北京市乃至全国知名的中西医男科学专家。

中国人民解放军总医院泌尿外科

综合性医院，集医疗、保健、教学、科研于一体。

泌尿外科在全军和全国领先，国际一流。

在泌尿外科领域有广泛的研究方向和科研特色。

上海交通大学医学院附属仁济医院男科

综合性医院，男科科室在国内具有较高的声誉。

特色诊疗包括无精子症规范化诊疗和勃起功能障碍、早泄诊疗。

北京协和医院男科

国内男科的先驱，男科学鼻祖。

在前列腺炎、男性不育、性功能障碍等方面有深入研究。

其他知名医院

海军军医大学附属长海医院

四川大学华西医院

华中科技大学同济医学院附属同济医院

中山大学孙逸仙纪念医院

以上排名基于复旦大学医院管理研究所发布的医院专科声誉排行榜，以及其他相关医疗机构的信息。请注意，排名可能会随着时间和各种因素（如医院服务质量、科研进展、患者评价等）的变化而有所调整。