巢湖市本地共有两所大学，分别是：

巢湖学院：

这是一所安徽省属全日制普通本科院校，同时也是地方性应用型本科院校。它由过去的巢湖师范学校升格而来，并被合肥市确定为重点建设大学。

合肥职业技术学院：

这是一所合肥市属的综合性高职院校，属于地方技能型高水平大学之一。它由巢湖卫校、安徽汽车运输技工学校等教育机构合并组建而成。

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