新疆南疆地区包括巴音郭楞蒙古自治州、阿克苏地区、喀什地区、克孜勒苏柯尔克孜自治州和和田地区，这些地区共有以下本科大学：

新疆科技学院- 位于库尔勒市，是自治区人民政府举办的省属普通高等学校，也是国家级产教融合试点。

新疆理工学院- 位于阿克苏地区。

喀什大学- 位于喀什地区，是一所历史悠久、学科门类齐全、办学特色鲜明的现代化综合性大学。

新疆和田学院- 位于和田地区，为当地提供本科教育。

新疆天山职业技术大学（克州校区）- 位于克孜勒苏柯尔克孜自治州，提供职业技术教育。

以上信息根据最近的数据更新，具体的教育资源和学术情况可能会有变化，建议联系相关院校或访问官方网站获取最新信息