济宁市的本科院校包括：

济宁医学院：

简称“济医”，是一所重点建设的医学院校，以医学教育为主体，同时发展多学科协调发展的本科教育。

曲阜师范大学：

简称曲阜师大，是一所由山东省教育厅与济宁市人民政府共建的综合性师范大学，也是山东省人民政府确立的重点建设高校。

济宁学院：

原济宁师范专科学校，是一所省属全日制普通本科高等学校，坐落在孔子故里曲阜。

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