根据提供的信息，2024年南京市高校普通大学生足球比赛暨江苏省大学生足球联赛（南京分会）预赛已经结束，以下是各组别的最终排名情况：

本科女子组

1. 南京工程学院

2. 南京医科大学

3. 南京林业大学

4. 南京特殊教育师范学院

高职高专男子组

1. 南京信息职业技术学院

以上排名根据比赛结果确定，南京信息职业技术学院在高职高专男子组中排名第一