根据2024年ABC中国大学排名，合肥市公办本科院校的排名如下：

1. 中国科学技术大学 - 全国第3名

2. 合肥工业大学 - 全国第54名

3. 安徽大学 - 全国第81名

4. 安徽医科大学 - 全国第139名

5. 安徽农业大学 - 全国第157名

6. 安徽中医药大学 - 全国第263名

以上排名基于最新发布的数据，具体排名可能会根据不同的评价标准和更新有所变化。