清华大学设有多个二级学院，以下是部分学院的列表：

1. 清华大学建筑学院

2. 清华大学土木水利学院

3. 清华大学机械工程学院

4. 清华大学基础医学院

5. 生物医学工程学院

6. 医疗管理学院

7. 临床医学院（北京清华长庚医院）

清华大学还设有其他学院和系，覆盖理学、工学、文学、历史学、哲学、经济学、管理学、法学、医学和艺术学等多个学科门类。

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