常熟理工学院的专业排名如下：

1. 财务管理

2. 自动化

3. 电气工程及其自动化

4. 软件工程

5. 机械电子工程

6. 工程管理

7. 电子信息工程

8. 日语

9. 统计学

10. 测控技术与仪器

这些专业根据历年平均录取分数线综合而来，可以认为是常熟理工学院的优势专业。