日本最高的大学排名如下：

东京大学

简称：东大（とうだい）

创办时间：

1877年

类型：国立综合性大学

特点：日本最古老的大学，亚洲顶尖的研究型大学，拥有丰富的学术氛围和先进的教学设施。

京都大学

简称：京大（きょうだい）

创办时间：

1897年

类型：国立综合大学

特点：日本第二古老的大学，以独立思考和判断能力为教育宗旨，被誉为“科学家的摇篮”。

东京工业大学

简称：东工大（とうこうだいがく）

创办时间：

1881年

类型：理工科大学

特点：日本顶尖的理工科大学，世界一流的理工大学，以工程技术与自然科学研究为主。

以上排名根据不同的评价体系和时间点可能会有所变化，但东京大学和京都大学通常被认为是日本最高水平的大学。